この問題の正解に pdbedit -x user1 がありますが、参考URLの www.samba.org　manpages「pdbedit(8)」 を参照すると、
-x の説明には 、

This option causes pdbedit to delete an account from the database. It needs a username specified with the -u switch.

-u の説明には 、

This option specifies the username to be used for the operation requested (listing, adding, removing). It is required in add, remove and modify operations and optional in list operations.

とあります。したがってpdbeditを用いたユーザ削除のコマンドは
pdbedit -x user1
ではなく
pdbedit -x -u user1
になるのではないでしょうか。確認をお願いします。