timedatectl set-ntp yes|no 解説では、このコマンドで「NTPの同期を有効にすると、chronyd（chronyデーモン）またはntpd（NTPデーモン）のいずれかインストールされている方が使用されます。」とありますが、使用されるNTPクライアントはsystemd-timesyncd.serviceではないのでしょうか？manページを読んでもそう書いてあるように思います。