質問の意味がわかりかねましたが、何とか解釈を試みると、以下のような質問でしょうか。

問題文だと合計10冊以上のマニュアルが必要ですが、正答とされている「10ライセンスパック1個，マニュアル5冊を購入」だと「おまけ1冊+追加5冊=6冊」なので、要件を満たさないのでは？

しかし「10ライセンスパック1個，マニュアル5冊を購入」という選択肢はありません。似ている選択肢として「10ライセンスパック5個，マニュアル5冊を購入」がありますが、そもそもこれは正答とされていません。何か勘違いがありそうなので、今一度問題をよく読んでみるとよいかもしれません。

正答は、「20ライセンスパック2個，1ライセンス10個を購入」ですね。
解説にあるように、この問題の正答は要件を満たしています。
各選択肢の解説（計算）の最後の行に、「購入ライセンス数」「購入マニュアル数」「（無料マニュアル数）」が記載されています。

・20ライセンスパック2個，1ライセンス10個を購入
→12,000円×40＋15,000円×10＝630,000円
ライセンス50個を購入(無料のマニュアルが12冊付属)

正答の場合はマニュアル数について「（無料のマニュアルが12冊付属）」と記載されています。
内訳を書きますね。
　20ライセンスパック1個につき、無料のマニュアルが1冊付属します。2購入 × 無料1冊 = 無料2冊です。
　1ライセンス1個につき、無料のマニュアルが1冊付属します。10購入 × 無料1冊 = 無料10冊です。
ですので合計は、2冊＋10冊＝12冊です。

他の３つの選択肢の解説部分も、この計算方法を念頭において見直してみることをおすすめします。あと、「マニュアルを〇冊購入」は表の「追加の場合1冊5,000円」部分にあたりますね。

ご質問の

「おまけ1冊+追加5冊=6冊」
がどこから導きだされたものかわからないのですが、
問題文が長かったり表の見方が難しくて勘違いが起きたのかもしれません。

いちおう、問題文もかみ砕きますね。
問題文の最初

本社の10部署に合計50台のPCがあり，表計算ソフトが50ライセンスと各部署に最低1冊，すなわち合計10冊以上のマニュアルを必要としている。

これを丁寧に記述すると、
　本社の10部署に合計50台のPCがあるという状況である。
　そのため、50台のPC用に表計算ソフトの「ライセンスが50個必要」。
　また、各部署に最低1冊はマニュアルが欲しいので、「マニュアルが合計10冊以上が必要」。
という内容です。

つまり簡単にいうと、「50ライセンスと10冊以上のマニュアルが必要」という意味です。